入金照合では振込人名、口座、金額、振込日、請求番号などから対象を確認します。同額だから同じ請求だと決め付けず、候補が複数ある場合は保留して調べます。
請求100,000円に60,000円だけ入金し、その請求へ充当する条件なら未回収は40,000円です。税・手数料等を省略した基本例の仕訳は、借方「普通預金60,000円」/貸方「売掛金60,000円」です。部分入金を全額回収にしません。
製品によっては元請求と部分入金を未消込明細で残す方法や、元請求を消して差額の残余明細を作る方法があります。どちらも債権残高は同じでも明細と期日の扱いが異なるため、自社の運用を確認します。